Biomarker Technologies veröffentlicht Leitfaden zur HMW-DNA-Aufbereitung
BMKGene hat technische Empfehlungen zur Handhabung von hochmolekularer DNA für die PacBio HiFi-Genomsequenzierung herausgegeben.
Biomarker Technologies (BMKGene) hat eine Anleitung zur Vorbereitung von hochmolekularer (HMW) DNA für die PacBio HiFi-Genomsequenzierung veröffentlicht. Die Erhaltung der Integrität langer DNA-Fragmente ist ein entscheidender Faktor für den Erfolg komplexer Genomassemblierungen.
Ana Vila-Santa, Leiterin des Bereichs Field Application bei BMKGene, weist darauf hin, dass lange DNA-Moleküle empfindlich auf mechanische Belastungen reagieren. Das Unternehmen empfiehlt daher, auf Vortex-Mischer zu verzichten und Pipettierschritte auf ein Minimum zu reduzieren, um vorzeitige Fragmentierungen der DNA zu vermeiden.
Das Unternehmen betont zudem, dass eine reine Konzentrationsmessung nicht ausreicht, um die Eignung einer Probe für die Sequenzierung zu bestimmen. Die Experten von BMKGene raten dazu, die Integrität der DNA mittels Gelelektrophorese zu prüfen. Intakte Fragmente sind die Voraussetzung dafür, dass Sequenziertechnologien wie PacBio HiFi repetitive Regionen präzise überbrücken können.
Diese technischen Empfehlungen ergänzen das bestehende Angebot an de novo-Genomsequenzierungsdienstleistungen des Unternehmens. Forschende werden dazu angehalten, die spezifischen Probenanforderungen vor Projektbeginn direkt mit den Fachleuten von BMKGene abzustimmen.