BMKGene kombiniert ATAC-seq und RNA-seq zur Aufklärung von Genregulierungsmechanismen

Biomarker Technologies (BMKGene) bietet integrierte ATAC-seq- und RNA-seq-Analysedienste an, um die Mechanismen der Genregulation zu entschlüsseln. Durch die Kombination dieser beiden Methoden können Forscher ein tieferes Verständnis dafür gewinnen, wie Veränderungen in der Chrominstruktur die Genexpressionsniveaus unter verschiedenen biologischen Bedingungen beeinflussen.

RNA-seq misst die Genexpression im gesamten Genom und identifiziert differentiell exprimierte Gene sowie ihre assoziierten Signalwege. ATAC-seq hingegen kartiert Regionen des zugänglichen Chromatin, was anzeigt, wo die Transkriptionsmaschinerie binden kann. Die Integration dieser Datensätze ermöglicht die Untersuchung, wie Veränderungen in der Chromatinzugänglichkeit mit Veränderungen in der Genexpression korrelieren.

BMKGene bietet Multiomik-Sequenzierungs- und Bioinformatikdienste zur Unterstützung dieser integrierten Analyse an. Das Unternehmen gibt an, dass dieser Ansatz über die Identifizierung 'welcher Gene sich verändert haben' hinausgeht, um zu untersuchen, 'welche regulatorischen Regionen sich verändert haben und wie diese Veränderungen mit der veränderten Genexpression zusammenhängen'.

Diese Integration kann helfen, regulatorische Regionen zu identifizieren, die spezifische Veränderungen der Genexpression direkt beeinflussen. Zum Beispiel liefert eine Zunahme der Genexpression, begleitet von einer erhöhten Chromatinzugänglichkeit in den Promotor- oder angrenzenden Regionen, Hinweise auf eine regulatorisch-expressionsbezogene Verbindung.