Biomarker Technologies veröffentlicht Leitfaden zur Qualitätssicherung bei snRNA-Sequenzierung
BMKGene-Experte Ziming Zhong erläutert die wesentlichen Qualitätskontrollschritte im Arbeitsablauf der Einzelzellkern-RNA-Sequenzierung.
Biomarker Technologies (BMKGene) hat einen technischen Leitfaden zur Qualitätssicherung bei der Einzelzellkern-RNA-Sequenzierung (snRNA-seq) veröffentlicht. In einer aktuellen Präsentation beschreibt Ziming Zhong, Senior Field Application Specialist bei BMKGene, die notwendigen Kontrollschritte, um die Datenintegrität von der Zellkernisolierung bis hin zur Bioinformatik zu gewährleisten.
Der Prozess stützt sich auf vier zentrale Kontrollpunkte. Zunächst wird die RNA-Qualität des Ausgangsmaterials bewertet. Im zweiten Schritt erfolgt eine Prüfung der isolierten Zellkerne auf Integrität und Verunreinigungen. Der dritte Punkt umfasst die Analyse der cDNA-Qualität und -Fragmentverteilung, gefolgt von einer abschließenden Bewertung der Sequenzierungsdaten.
Ziel dieses strukturierten Ansatzes ist es, technische Fehler frühzeitig zu identifizieren. Durch die kontinuierliche Überwachung der Probenqualität sollen Forscher in die Lage versetzt werden, fundierte Entscheidungen über die Fortsetzung ihrer Experimente zu treffen und das Risiko fehlerhafter Datensätze zu minimieren.