Tekoäly ja mikroskopia yhdistyvät geenien tutkimuksessa
Tutkijat ovat kehittäneet uuden teknologian, SPARCSin, joka yhdistää tekoälyn ja mikroskopian miljoonien geneettisesti muokattujen solujen seulontaan.
Ludwig Maximilianin yliopiston (LMU) tutkijat ovat yhdessä Max Planck -instituutin ja Helmholtz Munichin kanssa kehittäneet uuden menetelmän solujen geneettisen toiminnan tutkimiseen.
SPARCS-niminen teknologia yhdistää tekoälyn, mikroskopian ja geneettisen seulonnan, mahdollistaen miljoonien geneettisesti muokattujen solujen tarkan analysoinnin ja yksittäisten mielenkiintoisten solujen eristämisen. Tämä mahdollistaa solujen ulkonäön ja käyttäytymisen muutosten yhdistämisen niitä aiheuttaneisiin geneettisiin muutoksiin.
Tutkimuksessa analysoitiin tekoälyn avulla 70 miljoonaa solua ja tutkittiin erityisesti solun sisäistä kierrätysprosessia, autrofagiaa. Menetelmä tunnisti aiemmin tunnettuja geenejä ja löysi uusia, jotka vaikuttavat prosessiin. Lisäksi tutkittiin synnynnäisen immuunijärjestelmän STING-sensoria ja sen kuljetusta solussa.
Kehitetty teknologia avaa uusia mahdollisuuksia geenien systemaattiseen tutkimiseen ja biologisten löydösten edistämiseen. Tutkijat pystyivät analysoimaan eristettyjen solujen proteiinikoostumusta massaspektrometrialla, mikä auttoi geneettisten muutosten vaikutusten tarkassa karakterisoinnissa molekyylitasolla.