Automatisoitu tutkimus nopeuttaa hiivan biologian löytöjä

Chalmersin teknillisen yliopiston tutkijat hyödyntävät automatisoitua tutkimusta nopeuttaakseen löytöjä hiivan biologian alalla. Heidän työnsä keskittyy Saccharomyces cerevisiae -hiivan, malliorganismin soluprosesseille ihmisissä, analysointiin.

Ryhmä on kehittänyt puoliksi automatisoituja menetelmiä kokeiden suunnitteluun ja korkean kapasiteetin analyysiin. Näitä menetelmiä on käytetty tutkittaessa diauxic shift -prosessia, jossa hiivasolut siirtyvät sokerista ehtoollisen kulutukseen. Tutkimuksessa hyödynnettiin massaspektrometriaa ja robottitutkija EVEä, joka automatisoi suuren määrän rinnakkaisia kokeita.

Tutkijat pyrkivät ymmärtämään paremmin tätä monimutkaista prosessia, johon liittyy tuhansia proteiineja ja muita molekyylejä. Heidän havainnoillaan voi olla merkitystä myös muiden solujen toimintojen, kuten antioksidanttien ja ympäristöolosuhteisiin reagoimisen, ymmärtämisessä. Useita geenejä, joilla on tuntemattomia tehtäviä, on karakterisoitu tarkemmin.

Seuraavaksi ryhmä aikoo integroida menetelmät uuden sukupolven robottitutkija Geneesisin kanssa. Tavoitteena on tehdä tutkimusprosessista nopeampi ja älykkäämpi yhdistämällä eri biologisten tietojen tyyppejä metabolomiikan lisäksi.