AWS mahdollistaa neurotieteen tutkimuksen skaalautuvuuden

Amazon Web Services (AWS) on ottanut käyttöön ratkaisun, joka mahdollistaa Janelia Research Campuksen neurotieteen tutkimuksen skaalautuvuuden ja nopeuden parantamisen pilvessä. HHMI:n Janelian tutkimuskeskus käyttää AWS:ää tehostaakseen tieteellistä löytötyötä datan ja laskentatehon parannuksia vaativissa sovelluksissa.

Neurotieteellinen sovellus, jota Janelia käyttää, sisältää laskennallisesti vaativia kuvahakuja, joiden käyttö on ennakoimatonta. Perinteinen paikallinen ratkaisu vaatii tehokkaan työaseman ja suuren datamäärän lataamisen paikalliselle tallennustilalle, ja yhden haun suorittaminen voi kestää 30 sekuntia. AWS Lambdaan perustuva palvelimeton arkkitehtuuri suorittaa saman tehtävän sekunneissa muutamalla sentillä hakua kohden.

Erityisesti hedelmäkärpäsiin kohdistuva neurotieteen tutkimus vaatii valtavasti dataa ja laskentatehoa hedelmäkärpäsen noin 100 000 neuronin hermoverkoston tutkimiseksi. Janelian NeuronBridge-työkalu hyödyntää AWS:n pilvilaskentatehoa nopeuttamaan tieteellistä kehitystä.

Perinteinen lähestymistapa kuvahakuihin sisälsi 50 000 kuvan hakemisen 30 sekunnissa 16 ytimen työasemalla. AWS:n avulla saman tehtävän suorittaminen vie sekunteja ja on kustannustehokkaampaa, mahdollistaen myös suurempien datasettien käsittelyn.