Stowers-instituutin tutkija osallistuu 28,6 miljoonan dollarin hankkeeseen hermoston rappeumasairauksien ennustamiseksi
Stowers-instituutin tutkija Randal Halfmann saa osan 28,6 miljoonan dollarin apurahasta, jolla pyritään ennustamaan proteiinien muutoksia hermoston rappeumasairauksissa tekoälyn avulla.
Kansas City, Missouri – Hermoston rappeumasairauksiin, kuten Alzheimerin ja Parkinsonin tautiin, liittyvät proteiinien epänormaalit muodonmuutokset voivat vahingoittaa soluja. Nyt uusi, jopa 28,6 miljoonan dollarin tutkimushanke pyrkii tunnistamaan näitä muutoksia aikaisemmassa vaiheessa ja hyödyntämään tekoälyä niiden ennustamiseksi.
Stowers-instituutin tutkija Randal Halfmann, Ph.D., on valittu johtamaan osaa tästä kansallisesta tutkimuksesta. Halfmannin laboratorio saa noin 4,1 miljoonan dollarin rahoituksen kahdeksi vuodeksi Advanced Research Projects Agency for Health (ARPA-H) -virastolta. Tavoitteena on kerätä suuren mittakaavan kokeellista dataa proteiinien aggregaatiosta, eli niiden kasautumisesta, jota käytetään tekoälyn kouluttamiseen.
Tutkimuksessa keskitytään erityisesti niin sanottuihin luonnostaan epäjärjestyneisiin proteiineihin (IDP), joilla ei ole kiinteää rakennetta. Nämä proteiinit voivat aggregoitua ja aiheuttaa hermoston rappeumasairauksia. Halfmannin laboratorio käyttää kehittämäänsä DAmFRET-teknologiaa mitatakseen proteiinien kasautumista yksittäisissä elävissä soluissa yli 50 000 proteiinilla ja yli miljoonassa näytteessä.
Halfmannin mukaan tarkka tieto proteiinien kasautumisen todennäköisyyksistä ja alkamisajoista voisi mahdollistaa parempien ennaltaehkäisevien tai varhaisen vaiheen hoitojen kehittämisen ja kliinisten kokeiden kohdentamisen. Tutkimuksen tulokset voivat auttaa ymmärtämään sairauksien, kuten Alzheimerin ja Parkinsonin taudin, taustalla olevia mekanismeja syvemmin ja tarjota uusia lähestymistapoja hoitojen kehittämiseen.