Biomarker Technologies publie des conseils techniques sur la manipulation de l'ADN HMW
BMKGene propose des recommandations pour préserver l'intégrité de l'ADN de haut poids moléculaire lors de la préparation pour le séquençage PacBio HiFi.
Biomarker Technologies (BMKGene) a publié des directives techniques concernant la préparation de l'ADN de haut poids moléculaire (HMW) pour l'assemblage de génomes par la technologie PacBio HiFi. La conservation de la longueur des fragments d'ADN est essentielle pour garantir la qualité et la précision des résultats de séquençage.
Ana Vila-Santa, responsable des spécialistes des applications de terrain chez BMKGene, explique que les molécules d'ADN longues sont très sensibles aux dommages mécaniques. Le processus de manipulation doit être rigoureux, incluant l'évitement du vortex et la réduction des étapes de pipetage répétitives, afin de maintenir l'intégrité nécessaire au franchissement des régions répétitives du génome.
L'entreprise souligne par ailleurs que la concentration d'ADN n'est pas le seul indicateur de qualité. L'utilisation de l'électrophorèse sur gel est recommandée pour confirmer l'intégrité des échantillons avant toute soumission. Cette approche vise à minimiser les échecs liés à la fragmentation prématurée lors du séquençage.
Ces recommandations visent à accompagner les chercheurs utilisant les services de séquençage de novo de BMKGene. Il est conseillé aux utilisateurs de valider les protocoles de préparation avec l'équipe technique de la société avant de débuter leurs projets.