BMKGene intègre ATAC-seq et RNA-seq pour élucider les mécanismes de régulation génique

Biomarker Technologies (BMKGene) propose des services d'analyse intégrée ATAC-seq et RNA-seq pour élucider les mécanismes de régulation génique. En combinant ces deux méthodes, les chercheurs peuvent acquérir une compréhension plus approfondie de la manière dont les altérations de la structure de la chromatine affectent les niveaux d'expression des gènes dans diverses conditions biologiques.

Le RNA-seq mesure l'expression des gènes à travers le génome, identifiant les gènes différentiellement exprimés et leurs voies associées. L'ATAC-seq, en revanche, cartographie les régions de chromatine accessible, indiquant où la machinerie de transcription peut se lier. L'intégration de ces ensembles de données permet d'examiner comment les changements dans l'accessibilité de la chromatine sont corrélés avec les changements dans l'expression des gènes.

BMKGene propose des services de séquençage multiomique et de bioinformatique pour soutenir cette analyse intégrée. L'entreprise affirme que cette approche va au-delà de l'identification des 'gènes qui ont changé' pour explorer 'quelles régions régulatrices ont changé et comment ces changements sont liés à l'expression génique altérée'.

Cette intégration peut aider à identifier les régions régulatrices qui influencent directement les changements spécifiques de l'expression génique. Par exemple, une augmentation de l'expression d'un gène, accompagnée d'une accessibilité accrue de la chromatine dans ses régions promotrices ou adjacentes, fournit des preuves d'un lien régulation-expression.