L'épigénomique aide à débloquer les traits des cultures polyploïdes

Biomarker Technologies (BMKGene) met en avant le potentiel de l'épigénomique pour l'amélioration des plantes polyploïdes telles que le blé, le coton et la pomme de terre. Ces plantes, possédant trois jeux complets de chromosomes ou plus, présentent des défis génétiques considérables. Les méthodes traditionnelles de sélection, basées sur les séquences d'ADN et le génotypage SNP, échouent souvent à expliquer pleinement les différences phénotypiques de traits comme la tolérance à la sécheresse ou le rendement.

L'épigénétique fournit une couche supplémentaire de régulation génique en influençant l'expression des gènes sans modifier la séquence d'ADN sous-jacente. BMKGene suggère que les informations épigénomiques peuvent conduire à une compréhension plus approfondie de la dominance sous-génomique, de l'activation des gènes silencieux et de la stabilisation des génomes polyploïdes nouvellement formés. Les principaux mécanismes épigénétiques comprennent la méthylation de l'ADN, les modifications d'histones et la méthylation de l'ADN dirigée par ARN.

L'entreprise souligne l'importance de choisir des technologies d'analyse épigénomique appropriées pour l'étude des cultures polyploïdes. BMKGene compare des méthodes telles que l'EM-Seq (Enzymatic Methyl-Seq), le WGBS (Whole-Genome Bisulfite Sequencing), CUT&Tag/CUT&RUN et l'ATAC-Seq. Ces technologies offrent différentes résolutions et sont adaptées à l'identification de diverses marques épigénétiques, ce qui est crucial pour les génomes végétaux complexes.

À titre d'exemple, des recherches sur le cotonnier allotétraploïde ( Gossypium hirsutum) sont mentionnées, où des scientifiques ont analysé les interactions sous-génomiques. Comprendre la régulation épigénétique peut aider à élucider les traits agronomiquement importants des plantes. BMKGene propose des outils et des services pour soutenir la recherche végétale et promouvoir le développement de cultures plus efficaces et résilientes.