Les approches Multi-Omics transforment la recherche sur le cancer

Biomarker Technologies (BMKGene) explique comment les stratégies multi-omiques révolutionnent la recherche sur le cancer en intégrant diverses couches de données moléculaires pour comprendre le microenvironnement tumoral immunitaire (TME). Le TME est un écosystème complexe impliquant des cellules cancéreuses, immunitaires et stromales, dont les interactions sont cruciales pour la progression du cancer.

Selon BMKGene, aucune technique omics unique ne peut entièrement capturer la complexité de la biologie du cancer. Les approches multi-omiques, combinant génomique, épigénomique et transcriptomique, offrent une vision plus holistique. Cette intégration aide à identifier les altérations génétiques à l'origine des tumeurs, à comprendre les mécanismes de régulation épigénétique et à analyser la distribution spatiale et la fonction des cellules immunitaires au sein de la tumeur.

L'analyse génomique utilisant le séquençage du génome entier (WGS) et le séquençage de l'exome entier (WES) permet l'identification de mutations somatiques, de variations du nombre de copies et de signatures mutationnelles pouvant influencer l'immunité anti-tumorale. Les études épigénomiques, employant des techniques comme le séquençage du bisulfite du génome entier (WGBS) et l'ATAC-seq, révèlent comment la régulation des gènes affecte le comportement tumoral et la réponse au traitement.

De plus, la transcriptomique spatiale préserve l'architecture tissulaire tout en profilant l'expression génique, permettant aux chercheurs d'étudier la localisation et les interactions cellulaires. Combinée au profilage V(D)J pour les récepteurs des cellules T (TCR) et les récepteurs des cellules B (BCR), cette approche fournit des informations détaillées sur l'expansion clonale immunitaire et les réponses immunitaires anti-tumorales. BMKGene suggère que cette méthodologie intégrée est essentielle pour faire progresser le développement des thérapies contre le cancer.