AI används för att redesigna genredigeringsproteiner och öka säkerheten
Ny forskning använder AlphaFold AI för att omforma genredigeringsproteiner och minska oönskade effekter. Metoden syftar till att öka säkerheten för genterapier.
Forskare har använt AI-programvaran AlphaFold för att förbättra säkerheten hos genredigeringsproteiner. I en ny studie publicerad i Nature modifierades AI:n för att identifiera de delar av genredigeringsproteiner som är ansvariga för oönskade DNA-redigeringseffekter, så kallade off-target-effekter.
En av de största utmaningarna med genredigeringstekniker har varit deras säkerhet. Trots att teknikerna har blivit mer specifika för att rikta in sig på önskade gensekvenser, är det mänskliga genomet stort, och liknande DNA-sekvenser kan förekomma. Detta kan leda till oavsiktliga redigeringar på fel ställen i DNA:t. Även om risken för en enskild felredigering är låg, kan fel bli oundvikliga när terapier kräver redigering av många celler.
Genom att använda AlphaFold identifierades kritiska proteinregioner som orsakar off-target-effekter. Dessa regioner modifierades därefter för att minimera dessa problem. Målet är att göra genterapier betydligt säkrare för patienter.
Utvecklingen av säkrare genredigeringsproteiner kan påskynda tillämpningen av genterapier i framtiden, genom att ge bättre kontroll över riskerna med oönskade redigeringar.