Biomarker Technologies publicerar riktlinjer för hantering av HMW-DNA vid sekvensering
BMKGene har släppt instruktioner för hur man bevarar integriteten hos högmolekylärt DNA inför PacBio HiFi-genommonteringar.
Biomarker Technologies (BMKGene) har publicerat en instruktionsvideo gällande hantering av högmolekylärt (HMW) DNA för PacBio HiFi-genommonteringar. Bevarandet av DNA-fragmentens längd är avgörande för att säkerställa högkvalitativa sekvenseringsresultat.
Ana Vila-Santa, chef för fältapplikationsspecialister på BMKGene, betonar att långa DNA-molekyler är extremt känsliga för mekanisk påverkan. Bland de rekommenderade metoderna ingår att undvika vortex-blandning och begränsa antalet pipetteringssteg för att minska risken för fragmentering.
Utöver fysisk hantering betonar bolaget vikten av att analysera både koncentration och integritet hos DNA-proverna, exempelvis genom gelelektrofores. Att säkerställa att fragmenten förblir intakta under förberedelsefasen är en förutsättning för att lyckas med kartläggningen av repetitiva genomiska regioner.
Initiativet syftar till att vägleda forskare som använder BMKGenes tjänster för de novo-genomsekvensering. Företaget uppmanar kunder att stämma av specifika provkrav med deras experter inför projektstart.