Biomarker Technologies implementerar kontrollpunkter för snRNA-seq-analys

Biomarker Technologies (BMKGene) har introducerat ett nytt protokoll för kvalitetskontroll i arbetsflödet för enkelkärnig RNA-sekvensering (snRNA-seq). Syftet är att säkerställa hög datakvalitet genom att identifiera felkällor tidigt i processen, från initial provhantering till bioinformatisk analys.

Enligt företaget omfattar arbetsflödet fyra huvudkontroller. Först utvärderas provkvaliteten för att säkerställa att vävnadsmaterialet är lämpligt för isolering. Därefter analyseras kärnsuspensionens integritet för att undvika problem som cellaggregering eller RNA-läckage. Vidare genomförs kvalitetskontroll av cDNA-biblioteket innan den slutgiltiga sekvenseringen påbörjas.

Kvalitetsbristerna i snRNA-seq-analyser beror ofta på faktorer som sker innan själva sekvenseringen, såsom suboptimal tum-isolering eller degraderat RNA. Genom att integrera dessa kontrollpunkter hoppas företaget kunna minimera risken för förlust av transkriptomisk information och förbättra den totala precisionen i genuttrycksdata.

Företaget betonar att standardisering av varje steg i laboratorieprocessen är nödvändig för att forskare ska kunna säkerställa att de genererade sekvenseringsdata är representativa för de biologiska proverna.