Biomarker Technologies presenterar kvalitetskontroll för snRNA-sekvensering
Ziming Zhong från BMKGene redogör för de kritiska kvalitetsstegen inom arbetsflödet för sekvensering av enskilda cellkärnor (snRNA-seq).
Biomarker Technologies (BMKGene) har publicerat en genomgång av kvalitetskontrollprocesser för sekvensering av enskilda cellkärnor (snRNA-seq). Ziming Zhong, Senior Field Application Specialist, betonar i en nyligen släppt presentation att tillförlitliga data kräver noggranna kontroller genom hela arbetsflödet, från isolering av kärnor till slutgiltig dataanalys.
Kvalitetsarbetet struktureras kring fyra kontrollpunkter. Först utvärderas RNA-kvaliteten för att säkerställa att utgångsmaterialet är intakt. Därefter kontrolleras tumarnas integritet och renhet. Som tredje steg analyseras cDNA-bibliotekets kvalitet, och avslutningsvis granskas själva sekvenseringsdata.
Syftet med denna metodik är att tidigt identifiera potentiella problem i försöksuppställningen. Genom att integrera dessa kontrollsteg strävar företaget efter att ge forskare bättre underlag för att avgöra om ett prov håller tillräcklig kvalitet för vidare analys eller om materialet bör ersättas.